Сайт создан на платформе Nethouse. Хотите такой же?
Владельцу сайта
Перевести страницу

ЖУРНАЛ ЛАБОРАТОРИИ НАНОМИР

Волновая физика радиоэфира Фарадея-Максвелла

Рубиновая энергетика и эфироопорные двигатели

Пикотехнология белков 

Генная инженерия вечной молодости

Исследования мегалитов

Реинжиниринг инопланетных технологий




ДИСКУССИИ И ДЕТАЛИ

Пикотех - коррелляция первичной последовательности и вторичной структуры белка




Пикотехнология белков




2017.01.12 20:10:56

Формы, механизмы, энергия наномира

Пикотехнология белков, ДНК, РНК 

http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore … ureId=2ND1

http://www.uniprot.org/uniprot/O60885

http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/AAL26987


>ENA|AAL26987|AAL26987.1 Homo sapiens (human) bromodomain-containing 4
ATGTCTGCGGAGAGCGGCCCTGGGACGAGATTGAGAAATCTGCCAGTAATGGGGGATGGA
CTAGAAACTTCCCAAATGTCTACAACACAGGCCCAGGCCCAACCCCAGCCAGCCAACGCA
GCCAGCACCAACCCCCCGCCCCCAGAGACCTCCAACCCTAACAAGCCCAAGAGGCAGACC
AACCAACTGCAATACCTGCTCAGAGTGGTGCTCAAGACACTATGGAAACACCAGTTTGCA
TGGCCTTTCCAGCAGCCTGTGGATGCCGTCAAGCTGAACCTCCCTGATTACTATAAGATC
ATTAAAACGCCTATGGATATGGGAACAATAAAGAAGCGCTTGGAAAACAACTATTACTGG
AATGCTCAGGAATGTATCCAGGACTTCAACACTATGTTTACAAATTGTTACATCTACAAC
AAGCCTGGAGATGACATAGTCTTAATGGCAGAAGCTCTGGAAAAGCTCTTCTTGCAAAAA
ATAAATGAGCTACCCACAGAAGAAACCGAGATCATGATAGTCCAGGCAAAAGGAAGAGGA
CGTGGGAGGAAAGAAACAGGGACAGCAAAACCTGGCGTTTCCACGGTACCAAACACAACT
CAAGCATCGACTCCTCCGCAGACCCAGACCCCTCAGCCGAATCCTCCTCCTGTGCAGGCC
ACGCCTCACCCCTTCCCTGCCGTCACCCCGGACCTCATCGTCCAGACCCCTGTCATGACA
GTGGTGCCTCCCCAGCCACTGCAGACGCCCCCGCCAGTGCCCCCCCAGCCACAACCCCCA
CCCGCTCCAGCTCCCCAGCCCGTACAGAGCCACCCACCCATCATCGCGGCCACCCCACAG
CCTGTGAAGACAAAGAAGGGAGTGAAGAGGAAAGCAGACACCACCACCCCCACCACCATT
GACCCCATTCACGAGCCACCCTCGCTGCCCCCGGAGCCCAAGACCACCAAGCTGGGCCAG
CGGCGGGAGAGCAGCCGGCCTGTGAAACCTCCAAAGAAGGACGTGCCCGACTCTCAGCAG
CACCCAGCACCAGAGAAGAGCAGCAAGGTCTCGGAGCAGCTCAAGTGCTGCAGCGGCATC
CTCAAGGAGATGTTTGCCAAGAAGCACGCCGCCTACGCCTGGCCCTTCTACAAGCCTGTG
GACGTGGAGGCACTGGGCCTACACGACTACTGTGACATCATCAAGCACCCCATGGACATG
AGCACAATCAAGTCTAAACTGGAGGCCCGTGAGTACCGTGATGCTCAGGAGTTTGGTGCT
GACGTCCGATTGATGTTCTCCAACTGCTATAAGTACAACCCTCCTGACCATGAGGTGGTG
GCCATGGCCCGCAAGCTCCAGGATGTGTTCGAAATGCGCTTTGCCAAGATGCCGGACGAG
CCTGAGGAGCCAGTGGTGGCCGTGTCCTCCCCGGCAGTGCCCCCTCCCACCAAGGTTGTG
GCCCCGCCCTCATCCAGCGACAGCAGCAGCGATAGCTCCTCGGACAGTGACAGTTCGACT
GATGACTCTGAGGAGGAGCGAGCCCAGCGGCTGGCTGAGCTCCAGGAGCAGCTCAAAGCC
GTGCACGAGCAGCTTGCAGCCCTCTCTCAGCCCCAGCAGAACAAACCAAAGAAAAAGGAG
AAAGACAAGAAGGAAAAGAAAAAAGAAAAGCACAAAAGAAAAGAGGAAGTGGAAGAGAAT
AAAAAAAGCAAAGCCAAGGAACCTCCTCCTAAAAAGACGAAGAAAAATAATAGCAGCAAC
AGCAATGTGAGCAAGAAGGAGCCAGCGCCCATGAAGAGCAAGCCCCCTCCCACGTATGAG
TCGGAGGAAGAGGACAAGTGCAAGCCTATGTCCTATGAGGAGAAGCGGCAGCTCAGCTTG
GACATCAACAAGCTCCCCGGCGAGAAGCTGGGCCGCGTGGTGCACATCATCCAGTCACGG
GAGCCCTCCCTGAAGAATTCCAACCCCGACGAGATTGAAATCGACTTTGAGACCCTGAAG
CCGTCCACACTGCGTGAGCTGGAGCGCTATGTCACCTCCTGTTTGCGGAAGAAAAGGAAA
CCTCAAGCTGAGAAAGTTGATGTGATTGCCGGCTCCTCCAAGATGAAGGGCTTCTCGTCC
TCAGAGTCGGAGAGCTCCAGTGAGTCCAGCTCCTCTGACAGCGAAGACTCCGAAACAGAG
ATGGCTCCGAAGTCAAAAAAGAAGGGGCACCCCGGGAGGGAGCAGAAGAAGCACCATCAT
CACCACCATCAGCAGATGCAGCAGGCCCCGGCTCCTGTGCCCCAGCAGCCGCCCCCGCCT
CCCCAGCAGCCCCCACCGCCTCCACCTCCGCAGCAGCAACAGCAGCCGCCACCCCCGCCT
CCCCCACCCTCCATGCCGCAGCAGGCAGCCCCGGCGATGAAGTCCTCGCCCCCACCCTTC
ATTGCCACCCAGGTGCCCGTCCTGGAGCCCCAGCTCCCAGGCAGCGTCTTTGACCCCATC
GGCCACTTCACCCAGCCCATCCTGCACCTGCCGCAGCCTGAGCTGCCCCCTCACCTGCCC
CAGCCGCCTGAGCACAGCACTCCACCCCATCTCAACCAGCACGCAGTGGTCTCTCCTCCA
GCTTTGCACAACGCACTACCCCAGCAGCCATCACGGCCCAGCAACCGAGCCGCTGCCCTG
CCTCCCAAGCCCGCCCGGCCCCCAGCCGTGTCACCAGCCTTGACCCAAACACCCCTGCTC
CCACAGCCCCCCATGGCCCAACCCCCCCAAGTGCTGCTGGAGGATGAAGAGCCACCTGCC
CCACCCCTCACCTCCATGCAGATGCAGCTGTACCTGCAGCAGCTGCAGAAGGTGCAGCCC
CCTACGCCGCTACTCCCTTCCGTGAAGGTGCAGTCCCAGCCCCCACCCCCCCTGCCGCCC
CCACCCCACCCCTCTGTGCAGCAGCAGCTGCAGCAGCAGCCGCCACCACCCCCACCACCC
CAGCCCCAGCCTCCACCCCAGCAGCAGCATCAGCCCCCTCCACGGCCCGTGCACTTGCAG
CCCATGCAGTTTTCCACCCACATCCAACAGCCCCCGCCACCCCAGGGCCAGCAGCCCCCC
CATCCGCCCCCAGGCCAGCAGCCACCCCCGCCGCAGCCTGCCAAGCCTCAGCAAGTCATC
CAGCACCACCATTCACCCCGGCACCACAAGTCGGACCCCTACTCAACCGGTCACCTCCGC
GAAGCCCCCTCCCCGCTTATGATACATTCCCCCCAGATGTCACAGTTCCAGAGCCTGACC
CACCAGTCTCCACCCCAGCAAAACGTCCAGCCTAAGAAACAGGAGCTGCGTGCTGCCTCC
GTGGTCCAGCCCCAGCCCCTCGTGGTGGTGAAGGAGGAGAAGATCCACTCACCCATCATC
CGCAGCGAGCCCTTCAGCCCCTCGCTGCGGCCGGAGCCCCCCAAGCACCCGGAGAGCATC
AAGGCCCCCGTCCACCTGCCCCAGCGGCCGGAAATGAAGCCTGTGGATGTCGGGAGGCCT
GTGATCCGGCCCCCAGAGCAGAACGCACCGCCACCAGGGGCCCCTGACAAGGACAAACAG
AAACAGGAGCCGAAGACTCCAGTTGCGCCCAAAAAGGACCTGAAAATCAAGAACATGGGC
TCCTGGGCCAGCCTAGTGCAGAAGCATCCGACCACCCCCTCCTCCACAGCCAAGTCATCC
AGCGACAGCTTCGAGCAGTTCCGCCGCGCCGCTCGGGAGAAAGAGGAGCGTGAGAAGGCC
CTGAAGGCTCAGGCCGAGCACGCTGAGAAGGAGAAGGAGCGGCTGCGGCAGGAGCGCATG
AGGAGCCGAGAGGACGAGGATGCGCTGGAGCAGGCCCGGCGGGCCCATGAGGAGGCACGT
CGGCGCCAGGAGCAGCAGCAGCAGCAGCGCCAGGAGCAACAGCAGCAGCAGCAACAGCAA
GCAGCTGCGGTGGCTGCCGCCGCCACCCCACAGGCCCAGAGCTCCCAGCCCCAGTCCATG
CTGGACCAGCAGAGGGAGTTGGCCCGGAAGCGGGAGCAGGAGCGAAGACGCCGGGAAGCC
ATGGCAGCTACCATTGACATGAATTTCCAGAGTGATCTATTGTCAATATTTGAAGAAAAT
CTTTTCTGA


Композиционный код:

1,3,4,1,1,1,3,4,4,3,1,3,3,4,2,2,1,4,3,2,2,3,3,1,3,1,3,2,2,1,1,1,1,3,1,1,2,1,1,2,1,1,1,1,1,4,1,2,1,1,
1,1,3,1,1,1,1,1,1,1,1,3,4,3,1,4,1,3,4,4,1,1,2,2,1,3,1,1,3,2,1,3,1,1,1,3,4,3,1,1,1,4,1,1,3,3,1,3,1,1,
3,3,4,3,1,3,1,2,2,2,1,1,1,1,3,1,1,3,1,1,3,3,1,3,3,1,1,1,1,1,3,1,3,2,3,3,1,1,1,1,1,3,2,3,1,2,1,3,1,2,
3,3,4,3,1,1,1,1,3,3,2,3,1,2,1,2,3,3,1,1,1,1,2,1,1,2,3,2,3,2,3,4,1,3,3,2,4,2,2,3,3,1,3,1,4,2,2,1,2,3,
3,2,4,3,3,4,1,1,1,1,3,1,4,3,3,3,3,4,1,1,4,3,1,1,1,3,1,1,1,4,1,1,1,1,1,1,3,1,1,2,4,4,3,1,1,2,4,1,4,1,
4,2,4,1,1,1,2,3,1,2,1,3,2,3,1,1,1,2,1,1,1,2,1,1,1,4,1,1,2,1,3,4,1,2,1,1,2,4,1,1,3,2,1,1,1,1,1,1,1,3,
1,1,3,1,1,2,1,4,4,1,4,1,1,1,1,1,1,4,1,1,4,4,1,1,1,4,3,4,3,3,2,1,1,1,4,1,1,3,1,1,1,2,2,2,1,1,1,1,1,1,
4,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,3,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,3,4,1,4,1,2,4,1,2,1,1,1,3,1,1,1,1,1,1,1,1,1,
1,2,1,1,3,3,4,1,1,3,1,1,3,3,3,1,1,3,3,3,1,1,2,1,1,1,1,1,1,3,1,1,1,3,3,1,3,1,4,4,1,1,1,1,1,1,1,3,4,1,
3,1,1,3,1,1,1,4,1,1,3,1,1,2,4,4,1,4,1,1,4,2,4,1,3,1,1,1,3,4,1,4,1,2,1,1,1,1,1,1,3,1,1,4,1,3,1,3,4,3,
3,1,3,1,1,1,2,1,1,4,4,3,1,1,1,1,1,1,3,1,4,1,1,1,3,2,1,1,3,1,1,1,1,1,3,2,1,3,1,1,3,1,1,1,3,1,3,3,3,1,
1,3,3,3,1,3,4,3,1,3,3,3,1,3,1,1,3,3,3,3,3,1,4,1,3,3,3,1,1,1,1,3,4,1,1,1,1,2,4,1,1,1,1,1,1,3,1,4,3,1,
4,1,3,1,1,1,1,1,3,1,1,3,1,1,1,4,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,4,1,1,4,4,1,1,1,1,2,4,1,1,1,4,1,3,1,1,1,1,
1,3,3,1,1,3,1,1,4,1,4,1,2,4,3,1,4,1,1,3,1,1,1,3,1,4,1,3,1,3,3,3,3,1,3,3,3,4,3,1,1,1,1,1,1,1,1,1,4,1,
2,1,4,1,1,1,3,1,1,1,1,3,1,1,3,1,1,3,2,1,1,3,4,1,2,3,1,1,4,1,1,4,1,1,1,1,1,1,3,3,1,1,3,1,1,1,1,1,1,4,
3,3,4,1,1,1,4,1,4,3,1,1,1,1,2,4,3,2,3,4,1,1,3,1,1,4,2,1,4,3,1,2,1,1,1,4,1,1,2,1,4,4,1,1,1,4,1,2,1,1,
3,1,1,1,4,1,1,4,1,1,1,1,2,1,1,1,3,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,4,1,4,4,1,3,1,4,1,3,1,4,1,1,4,3,1,1,1,3,2,1,3,
1,1,1,1,2,4,1,3,3,2,3,1,1,1,2,2,1,1,1,2,2,4,1,1,1,2,1,3,1,4,3,1,1,1,1,4,1,2,1,4,2,2,1,1,1,3,2,1,4,1,
2,1,1,1,1,1,3,1,1,3,4,4,4,1,3,3,1,2,3,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,4,1,4,1,1,4,1,1,4,1,1,3,4,4,2,1,3,1,4,1,4,
1,1,1,1,2,1,1,4,4,1,2,1,1,1,3,4,1,1,1,4,1,1,1,4,2,2,1,2,2,1,1,1,1,3,2,1,1,1,1,3,1,1,3,2,4,1,4,1,1,1,
1,1,1,3,1,1,1,1,3,1,1,4,2,1,1,1,1,1,1,1,3,4,1,2,1,1,1,2,1,4,4,1,3,1,1,3,1,3,1,1,1,1,1,3,2,1,4,1,1,1,
4,1,1,1,2,1,3,1,1,1,3,1,1,1,4,3,1,2,3,1,1,1,1,2,1,1,1,1,4,1,1,1,3,2,1,1,3,1,1,1,3,1,3,1,1,4,3,3,1,1,
4,1,1,1,1,1,1,4,4,4,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,4,4,4,4,1,1,1,1,1,4,1,1,1,1,1,1,1,1,4,1,1,4,4,
3,1,1,3,4,3,1,4,1,3,4,1,4,1,2,1,1,1,2,4,2,2,4,1,3,1,1,1,3,1,3,1,1,4,1,3,2,3,4,1,3,1,1,4,3,1,1,1,1,1,
1,1,1,1,2,4,1,1,3,4,1,1,1,1,1,2,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,3,4,1,3,1,1,3,1,1,1,4,1,3,1,1,1,1,3,1,1,
1,1,1,4,4,4,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,3,4,4,1,1,1,4,4,1,3,1,1,2,3,4,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,3,1,1,1,1,3,1,3,
2,3,4,4,3,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,4,1,1,1,1,1,1,1,4,1,4,1,1,1,2,3,1,4,3,1,1,2,3,1,3,1,1,3,1,1,
3,3,2,1,2,2,3,3,3,3,3,1


Вторичная структура (Пикотех): https://img-fotki.yandex.ru/get/195419/ … 4_orig.gif


https://img-fotki.yandex.ru/get/122076/158289418.3bf/0_170243_1d83303d_orig.png


Кушелев: Любопытный фрагмент структуры...


https://img-fotki.yandex.ru/get/224193/158289418.3bf/0_170244_9266a9c0_orig.png


https://img-fotki.yandex.ru/get/95629/158289418.3bf/0_170245_af9b706f_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/198488/158289418.3bf/0_170246_38a453a9_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/196142/158289418.3bf/0_170247_b39cbdc0_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/43388/158289418.3bf/0_170248_c78de507_orig.png


Кушелев: Интересно, что это за участки белка такие необычные?


https://img-fotki.yandex.ru/get/196486/158289418.3bf/0_17025e_97b8bb30_orig.png


Кушелев: Обратите внимание на корреляцию вторичной структуры с аминокислотными остатками. Gln (глутамин) находится в структуре прямой альфа-спирали, а Pro (пролин) в структуре бета-спирали и краёв.




2017.01.12 20:41:06

Формы, механизмы, энергия наномира.

Пикотехнология белков, ДНК, РНК 


https://img-fotki.yandex.ru/get/196486/158289418.3bf/0_17025e_97b8bb30_orig.png
Кушелев: Все видят корреляцию?

https://img-fotki.yandex.ru/get/196010/158289418.3bf/0_17027c_adf3ee8_orig.png


Такая корреляция наглядно показывает предсказательную силу пикотехнологии даже на уровне 2D-структуры.


https://img-fotki.yandex.ru/get/61266/158289418.3bf/0_17027d_df19ad12_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/197923/158289418.3bf/0_17028e_455c9b30_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/195637/158289418.3bf/0_1702b1_a19e23f8_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/114207/158289418.3bf/0_1702b2_8171e69d_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/55918/158289418.3bf/0_1702b3_c5186377_orig.png


Кушелев: Корреляция вторичной структуры по таблице композиционного кода с первичной последовательностью белка, в частности, иминокислоты Pro, очевидна.



А первичная последовательность в отличие от данных РСА имеет 100%-ную надёжность