Отладка Пикософта

2017.03.23 19:04:59

Пикотехнология белков, ДНК, РНК

[22.03.2017 18:49:44] Кушелев Александр Юрьевич: А список меню постепенно растёт...
1. 2D-структура в новом формате.
2. Файл в стандарте MIDI
3. Компактный файл fasta (с отработанными Join и Complement)
4. Компактный файл dne/embl (только идентификатор белка и входной код. С простым CDS 1..n)
5. 2D-структура в старом формате (как сейчас) с разбивкой по 1000 строк. 1600 строк Яндекс уже не принимает.
6. Композиционный код-6
7. Композиционный код-4
[0:59:29] Кушелев Александр Юрьевич: На моём "быстром" компьютере 6-секундная задачка посчиталась чуть больше, чем за 25 часов: https://cloud.mail.ru/public/6rgP/M4uPi4cwM
[1:04:52] Кушелев Александр Юрьевич: Фотошоп открыть не может. Просмотр картинок виндов тоже.
[11:39:47] Кушелев Александр Юрьевич: Привет!
[11:40:31] Кушелев Александр Юрьевич: Наиболее актуальная тема - новый стандарт вторичной структуры белка:

[11:40:38] Кушелев Александр Юрьевич: Это решает сразу ряд проблем.
[11:40:53] Кушелев Александр Юрьевич: Длина картинок сокращается примерно в 100 раз!
[11:42:23] Va12220(Valqwa): Саша привет. Не суетись. Ты забрасываешь меня картинками, я их смотрю. а что дальше. Ты как-то формируй задачу
[11:44:42] Кушелев Александр Юрьевич: Берём за основу 60 символов в строке. Каждый символ - краткое название аминокислоты. И под каждый символ подкладываем фон своего цвета. Цвет вычисляется по тому же алгоритму, как цвет "кирпичей" для варианта-6
[11:45:10] Кушелев Александр Юрьевич: Терминирующий кодон или NNN - чёрный цвет. Символы белого цвета.
[11:46:38] Кушелев Александр Юрьевич: Участок с Q-спиралью должен выглядеть, как на рисунке, т.е. чередование красного и синего:

[11:49:02] Va12220(Valqwa): и все? так просто ?
[11:51:30] Кушелев Александр Юрьевич: Да. Вот так примерно выглядят сами символы:

[11:51:53] Кушелев Александр Юрьевич: Но их надо сделать белого цвета, а под каждый символ подложить фон нужного цвета
[11:52:12] Кушелев Александр Юрьевич: А фон вычисляется как для столбца "вар 6"
[11:52:46] Кушелев Александр Юрьевич: А с музыкой придётся отдельно работать. Просто выводить миди
[11:53:18] Кушелев Александр Юрьевич: А миди я могу загружать в программу MuseScore и дальше уже обрабатывать, как позволяет эта программа.
[11:54:08] Кушелев Александр Юрьевич: Но актуальнее всего именно новая 2D-структура, т.е. белые символны на цветных клетках
[11:59:35] Кушелев Александр Юрьевич: Ещё раз с цветами.
1-красный [255,0,0]
2-зеленый [0,255,0]
3-синий [0,0,255]
4-оранжевый [255,180,0]
5-розовый [255,200,200]
6-[255,0,255]
[12:00:53] Кушелев Александр Юрьевич: Ну и в самом верху идентификатор, точнее верхняя строка из фасты или embl
[12:25:26] Кушелев Александр Юрьевич: Долго делать такую программу?
[12:28:43] Va12220(Valqwa): "Рубин-пьезокерамический проект лаборатории"
Va12220(Valqwa): а я не в курсе )
[12:29:07] Va12220(Valqwa): Не долго.
[12:30:10] Кушелев Александр Юрьевич: ЗдОрово!
[15:39:03] Va12220(Valqwa): нашел пару вариантов как сделать что бы быстрее обрабатывались изображения.
[16:47:21] Кушелев Александр Юрьевич: А можно взять файл embl и просто "подкрасить" фон? Есть в языке html возможность подкрашивать фон под символами?
[17:16:36] Кушелев Александр Юрьевич: Можно! http://www.computerhope.com/issues/ch001391.htm
[17:19:55] Кушелев Александр Юрьевич: Короче, нужно воспользоваться этим:
<html lang="ru-RU"><body><head>1</head>
POIUPOUPOIUPOPOIUPOIUPOIU
</body></html>
[17:22:34] Кушелев Александр Юрьевич:

[17:30:03] Кушелев Александр Юрьевич: На входе программы будет, например, такой файл: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/921129204
[17:30:30] Кушелев Александр Юрьевич: В нём содержится блок:
[17:30:32] Кушелев Александр Юрьевич: /translation="MGDPSLLSPLTRSCLREGAPRALWGPSSFEGSSTLPGGPPPSTS
LSLCVWGPPGGPPPSTLGAPPSGASSSSPGPSLSCCGASPSQSQQQQPLLPLPAAAHS
LDHLGAPGGPPGAPEGAPGAPEGALCGAPGPSLPAAALGAAAGALCPWGPPGPGAPGG
PPGAPGAPGVLALPLAGPPGGPPGGPPGAPGGPEALRPRAPRLQEVARGVFLANRVLI
EYPGEQQLPTEVRLALKHPHGYQLRRMHPPRPPEGAPHRGPQGPPGAPGAPGAPGAPG
APGAPGDPQKGPHGRRAQLQQQLCRGDGGPKRPKRPGPCSSSSSSSSSSSSSSSSPCL
VSSQQAPNCLQILPAEAPQTALTPEWGPLDELGAPGGPPGAPGGPGGPGGPPCVCSEC
GRCRAFAEAKKLLRPFGVHLHFGAFQELQQQKGGPPGSFGGPGGPPTAAAGGPPEGGP
LALALACLPGPQEGPPGPGGPPGGPPGAPEPGDCICAAAASQQGGPPAAGGAPGGPPC
QLRGYLVVDQMPAKELAALEAAAAIKRALSYFLLEAPPPAAATAAAAAAAAAAARGAR
ASSRADGEGALPQHAKGPVAAVKLLPQQQQQQQQQQGFEGAAAAASSSGGDCFKRAPA
PSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSRAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCWRGCWTQ
WCSCTTWTAAAAKQQSAATTSAASSATTEQSFLLEHEEALEAEFPRGFAAAKQQQQEA
KRKRALNPSGAPEGPRELEAPAAAEEQQVLNGALRLGPSFTLHGFIFEGPRQARALLK
LLKAFVNRHELLQTGAPGGPPGGPPGGPCTYSSFVAAAAAHHSFEAKSLSLASRKALG
APLQVFLVVSNFRVRGARVTDCRVSFSDTLIALEGGAAKSVKRLRIKGLLLPQSQRLL
LSAVRTLQQARCLSGASLTFTFIKQPHSAAAFYEPGLALCFPGERHPHPQQQQQQQQQ
QQQQQQQQQQQRVAAQVWRHFENFGGLLLQSHCRLFAALRALAPHTVWGAKAQQQRQA
SLQQQQQAAARDAAAAAAAAAAEAAAAAAAARAAQQQPLAALTCDSSRDHLGAPEAPA
LFYCCHPDILEQLPPQLLQQTPVECLVSSLYFKFAAKYGGPPPFDAELCPLLRPPWLG
ALKALKSKPGGPRGAPLSSSRGGAPSSSKEEAGAPKRKTFVCIVDGEEDPDAPVNSYR
GGVTSALSSIIRMALEEMSGSGKAAACLSVSSTIAAAAAAAAAAAAAEASAAAAAQAP
AAGAAETALAAAETPAGAAAAAAAPAAAAAAAAAAAAAAGGRCVEVFGVLLVDPCCCA
AAAAQMRALLLLHAKAPKGFLALHFVTASWAYASVLEGQLNSPAAQQHQLQLGAPQLG
APLEGAPQEEAPARGEGPQLGPPGGPGGPQLLPGWGPTGAAAEGPQALSAAAEGPPLP
HIAQVLKEPWGLPLFGWLLLMPESCLLSLSLPREELQQQWGASILLLPSLAPLAVLRA
LLSFLLSHGIDPTRAPLDLPCLPVFAAVLAPEGPPEGPPEGPLEGPPEGLPLGALGGP
PGGDPGARRSFSPLGGPRGAPATPTRSSSRGAPLLSSSPLKLGKCGSPQPAAPACDAG
GPRGSPGGPQGTGGPQGTGLCLGLGAPVGTPSKLRARGSSPLGSRGPPSSPLGPPAGG
APSTPRRGPSATPRGSSLPNGGPPTLPQGPSTPLRGPSTPLRGPSALLRGPSTPLRGP
STPLRGPRTPLRGPSTPLRGPRTPSRGPRSVRCGRLSPLGAPLGAPLGAPLGAPLGVA
GSPFRGSRANLSVHQRGGPPRPCRAHFCAASSSYKVAVGPLKIFLPGLEGLPLVSSKW
ATCSLAARRLLPLQHFALRPSSQQQQQQQQQQQQQQQQQRAGRAAAAQQPQAAAGGGP
SLPASPSLKRPLDAGAPPPPKRRQRGSSSQQAAAAEAAAAEAAAAEAAAAAAEPAAAA
GEGPLPGPARTPKERLVAAPAAAATAAAARATATAAAAAAAAAAAASDVSEAAGSAAP
AAASSRSSSRAPRRGRAVGLAAAEAGPLPAAETLNPQTLNPQALNPRAAPPQAPNLRV
AKTRARAKAAPKAAQQPQQEQQEQQEQQQQQQQEQQQEELTAAAEPAKRAARKAAATR
RGSRRGTGK"
[17:31:10] Кушелев Александр Юрьевич: Его нужно будет вырезать из файла, раскрасить и снова вставить в файл html
[18:48:18] Кушелев Александр Юрьевич: Вот так должен выглядеть кусок htm-файла после "раскрашивания":

[18:48:39] Кушелев Александр Юрьевич: Черные участки соответствуют кодонам NNN (если такие бы там были)
[18:50:03] Кушелев Александр Юрьевич: А вот сам фрагмент файла html: https://cloud.mail.ru/public/9tVS/dZgftBwLb
[18:50:30] Кушелев Александр Юрьевич: Сможешь написать программу, которая будет сохранять такие html-файлы?
[18:51:56] Кушелев Александр Юрьевич: С одной стороны длина визуализируемой структуры уменьшится в десятки раз, а с другой стороны htm-файл может быть очень длинным.
[18:52:21] Кушелев Александр Юрьевич: Он ещё будет достаточно компактным по сравнению с графическим файлом.

diprospan пишет:

Биологи заглянули в «моторный отсек» запускающего репликацию комплекса
https://nplus1.ru/news/2017/03/23/ORCstructure

Кушелев: Очень любопытно. А что они там увидели, если не секрет?

https://nplus1.ru/news/2017/03/23/ORCstructure
Во время репликации специальные ферменты расплетают двойную спираль
и разводят ее нити в стороны, создавая репликационную вилку.
Дальше ДНК-полимераза использует материнскую цепь как шаблон и
скрупулезно ставит напротив имеющихся нуклеотидов положенные им пары.
Так на основе каждой из двух цепей возникает еще по одной.
https://elifesciences.org/content/6/e20818
https://ru.wikipedia.org/wiki/Репликационная_вилка

Кушелев: Очень интересно. Давайте мы этот белок попробуем смоделировать в программе Пикотех. Конечно, пока не готова версия с ручной настройкой, модель будет неточной, т.к. физика не учитывается... Но всё равно интересно посмотреть на модель. Она может оказаться близка по форме (по крайней мере форме фрагментов, разделённых пролинами).

2017.03.19 00:52:34

Уважаемые коллеги, друзья!

Благодаря Вашей широкой поддержке, лаборатория Наномир может получить государственную поддержку, а это значит, что появится возможность перейти на штатный режим работы, т.е. в лаборатории могут появиться штатные сотрудники: инженеры, программисты, менеджеры, специалисты по СВЧ, лазерной техники и по другим специальностям. Возможно, что на базе лаборатории Наномир будет создан институт или академия.

Естественно, что в первую очередь в штат будут зачислены те специалисты, которые уже сотрудничают с лабораторией Наномир на общественных началах. И таких специалистов становится всё больше.

В настоящее время очень актуально создание программы, которая будет корректно обрабатывать генетический код белка и сохранять данные в графическом виде и в виде файлов MIDI, PDB и др.

Музыкальный файл в стандарте МИДИ / MIDI: https://cloud.mail.ru/public/De6u/NSAaxnEDF

3D модель в стандарте PDB: https://cloud.mail.ru/public/6uPW/thMzkh1AG

Кто из программистов желает связать свою судьбу с лабораторией Наномир, может сделать это уже сегодня. В случае государственной поддержки он автоматически будет зачислен в штат лаборатории Наномир.

2017.04.08 02:43:12

[31.03.2017 21:50:22] Va12220(Valqwa): проверь
[31.03.2017 21:55:26] Кушелев Александр Юрьевич: Работает отлично!
[31.03.2017 21:55:53] Кушелев Александр Юрьевич: Теперь Бог программирования может расслабиться и не спеша доделать вывод миди
[31.03.2017 21:56:12] Va12220(Valqwa): не понял. не работает ?
[31.03.2017 21:56:17] Кушелев Александр Юрьевич: Работает!
[31.03.2017 21:56:21] Кушелев Александр Юрьевич: Отлично!
[31.03.2017 21:56:35] Кушелев Александр Юрьевич: Программку-то пришли
[31.03.2017 21:56:47] Кушелев Александр Юрьевич: Я же вручную сейчас лопачу...
[31.03.2017 21:57:41] Va12220(Valqwa): лопач пока я миди пишу.
и ещё то что выслал тебе надо сейчас будет встроить в общую программу
[31.03.2017 21:58:45] Кушелев Александр Юрьевич: Подожду. Пока не буду лопатить. С волшебной прогой я в миллион раз быстрее перелопачу
[31.03.2017 22:31:55] Va12220(Valqwa): Кушелев"Что касается NNN, то для миди это - пауза"
Va12220(Valqwa): пауза в формате миди - это ЧТО ?
[31.03.2017 22:33:01] Va12220(Valqwa): dne - встроил.
[31.03.2017 22:33:14] Va12220(Valqwa): продолжаем миди
[31.03.2017 22:38:57] Va12220(Valqwa): где ты там. ? )
будем сейчас с тобой уточнять все по миди.
[31.03.2017 22:45:46] Кушелев Александр Юрьевич: Пауза когда не звучит нота. Если некогда разбираться ставь ноту под номером 115
[31.03.2017 22:46:17] Va12220(Valqwa): сколько времени нота не звучит ?
[31.03.2017 22:46:41] Кушелев Александр Юрьевич: Столько же
[31.03.2017 22:46:49] Va12220(Valqwa): уточни
[31.03.2017 22:47:00] Va12220(Valqwa): в секундах
[31.03.2017 22:47:10] Кушелев Александр Юрьевич: Как по коду 1,4,5 (шестнадцатая)
[31.03.2017 22:47:22] Кушелев Александр Юрьевич: По коду 3 восьмая
[31.03.2017 22:47:38] Кушелев Александр Юрьевич: По коду 2 четвертушка
[31.03.2017 22:47:44] Va12220(Valqwa): в секундах это сколько ?
[31.03.2017 22:49:02] Кушелев Александр Юрьевич: Ты таблицу редактируемую сделай. Я подберу в секундах
[31.03.2017 22:49:35] Кушелев Александр Юрьевич: Шестнадцатая - это, вероятно, шестнадцатая доля секунды
[31.03.2017 22:50:05] Va12220(Valqwa): тогда скажи при чем тут код и про какой код ты говоришь
[31.03.2017 22:50:10] Кушелев Александр Юрьевич: Раз-и - это четвертная. Она звучит секунду
[31.03.2017 22:50:17] Кушелев Александр Юрьевич: Композиционный
[31.03.2017 22:50:37] Va12220(Valqwa): ты вот мне сказал
берем триплеты и им присваиваем ноты

01 AAC 0 71
02 AAG 0 66
03 AAT 0 71
04 ACA 0 76
[31.03.2017 22:50:53] Кушелев Александр Юрьевич: Композиционный код-6
[31.03.2017 22:51:03] Кушелев Александр Юрьевич: Ему соответствует длительность нот
[31.03.2017 22:51:09] Va12220(Valqwa): сейчас ты начинаешь говорить что замешан ещё композиционный код
[31.03.2017 22:51:21] Va12220(Valqwa): поправился 6й. уже ближе
[31.03.2017 22:51:34] Кушелев Александр Юрьевич: 1,5 и 6 - длительность 1/16, т.е. четверть секунды
[31.03.2017 22:52:18] Кушелев Александр Юрьевич: код 3 - длительность 1/8, т.е. пол секунды
[31.03.2017 22:52:22] Va12220(Valqwa): что ещё ты не досказал?
[31.03.2017 22:52:32] Кушелев Александр Юрьевич: Код 2 - длительность 1/4, т.е. секунда
[31.03.2017 22:52:50] Va12220(Valqwa): например если код 0, то это пауза длительностью какой ?
[31.03.2017 22:53:13] Кушелев Александр Юрьевич: Сейчас табличку напишу. Пауза - самая короткая нота
[31.03.2017 22:53:18] Кушелев Александр Юрьевич: с номером 115
[31.03.2017 22:53:37] Va12220(Valqwa): давай табличку от нуля до 6ти )
[31.03.2017 22:54:19] Va12220(Valqwa): в секундах )
[31.03.2017 22:54:48] Кушелев Александр Юрьевич: Код-6 длительность (секунд)
0,1,4,5,6 0.125
3 0.25
2 0.5
[31.03.2017 22:56:11] Va12220(Valqwa): хорошо.
ноты - те что ты ранее указал +115я нота для NNN и для кода 0 ?
[31.03.2017 22:56:19] Кушелев Александр Юрьевич: Да
[31.03.2017 22:57:25] Va12220(Valqwa): )) ничего не забыл ) ?
[31.03.2017 22:58:22] Кушелев Александр Юрьевич: Ты главное таблицу нот, инструментов и длительностей сделай в виде входного файла, чтобы можно было редактировать
[31.03.2017 22:59:04] Va12220(Valqwa): а инструменты куда цепляются ?
[31.03.2017 23:00:12] Кушелев Александр Юрьевич: Каждая аминокислота - нота своего инструмента. В таблице нужно задавать не только ноту, но и инструмент
[31.03.2017 23:00:29] Va12220(Valqwa): в какой таблице?
[31.03.2017 23:00:35] Кушелев Александр Юрьевич: А лучше не аминокислота, а триплет кода
[31.03.2017 23:01:01] Кушелев Александр Юрьевич: В таблице композиционного кода мы писали номера нот в стандарте миди. А нужно ещё номер инструмента
[31.03.2017 23:01:15] Кушелев Александр Юрьевич: и длительность
[31.03.2017 23:01:25] Кушелев Александр Юрьевич: Для всех 64 триплетов
[31.03.2017 23:01:37] Кушелев Александр Юрьевич: Ты пустую таблицу мне пришли, а я заполню
[31.03.2017 23:01:54] Кушелев Александр Юрьевич: Входные данные - триплеты генетического кода
[31.03.2017 23:01:55] Va12220(Valqwa): ты что-то непонятное речешь на ночь глядя.

таблица композиционного кода - это 0-6 и тут мы писали только длительность нот
[31.03.2017 23:02:56] Кушелев Александр Юрьевич: В таблице там и композиционный код (столбец) и номер ноты (столбец в конце) и нужно добавить номер инструмента
[31.03.2017 23:03:01] Va12220(Valqwa): а до этого ты мне дал соответствие нот триплетам
[31.03.2017 23:03:09] Кушелев Александр Юрьевич: Да
[31.03.2017 23:03:14] Кушелев Александр Юрьевич: Ноты остаются
[31.03.2017 23:03:23] Кушелев Александр Юрьевич: Но их придётся играть на разных инструментах
[31.03.2017 23:03:32] Кушелев Александр Юрьевич: и с разной длительностью
[31.03.2017 23:03:35] Va12220(Valqwa): номера инструмента ты пока что ничему не присваивал
[31.03.2017 23:03:44] Кушелев Александр Юрьевич: И всё это нужно редактировать во входной таблице
[31.03.2017 23:03:59] Кушелев Александр Юрьевич: Давай таблицу, присвою
[31.03.2017 23:04:09] Кушелев Александр Юрьевич: Глицин должен звучать, как бас-барабан
[31.03.2017 23:04:14] Кушелев Александр Юрьевич: Пролин, как маракас
[31.03.2017 23:04:22] Кушелев Александр Юрьевич: А остальные - рояль
[31.03.2017 23:08:36] Va12220(Valqwa): т.е. каждому триплету ты присвоишь помимо ноты ещё инструмент
[31.03.2017 23:09:04] Кушелев Александр Юрьевич: Да. И длительность
[31.03.2017 23:09:24] Va12220(Valqwa): и длительность чего ?
[31.03.2017 23:09:37] Кушелев Александр Юрьевич: длительность звучания ноты
[31.03.2017 23:10:14] Va12220(Valqwa): но ты длительность звучания присвоил через композитный код. нота и триплет уже не при чем
[31.03.2017 23:10:40] Кушелев Александр Юрьевич: Годится
[31.03.2017 23:10:54] Va12220(Valqwa): что годится ?
[31.03.2017 23:11:18] Кушелев Александр Юрьевич: Но лучше длительность внести в таблицу, чтобы можно было поменять таблицу и поменялись бы длительности.
[31.03.2017 23:11:35] Кушелев Александр Юрьевич: В одном случае нужно, чтобы длительности были разные, а в другом - одинаковые
[31.03.2017 23:11:36] Va12220(Valqwa): в какую таблицу ?
[31.03.2017 23:11:50] Кушелев Александр Юрьевич: Как кирпичи, чтобы была отдельным файлом
[31.03.2017 23:12:01] Va12220(Valqwa): какую таблицу ?
[31.03.2017 23:12:09] Кушелев Александр Юрьевич: И чтобы можно было заменить таблицу с одинаковыми длительностями на таблицу с разными
[31.03.2017 23:12:14] Кушелев Александр Юрьевич: Таблицу кода
[31.03.2017 23:12:23] Кушелев Александр Юрьевич: Где прописать ноты длительности и инструменты
[31.03.2017 23:12:59] Va12220(Valqwa): саша. ты про КАКУЮ таблицу говоришь ? я не понимаю
[31.03.2017 23:13:22] Va12220(Valqwa): у меня сейчас есть ВШИТАЯ таблица вот такая

0 'aaa' 'K' 'Lys' ' ' 3 746 'F#1' 'H1' 66
1 'aac' 'N' 'Asn' ' ' 1 995 'H1' 'E2' 71
2 'aag' 'K' 'Lys' ' ' 1 746 'F#1' 'H1' 66
3 'aat' 'N' 'Asn' ' ' 3 995 'H1' 'E2' 71
4 'aca' 'T' 'Thr' ' ' 2 1328 'E2' 'A3' 76
5 'acc' 'T' 'Thr' ' ' 1 1328 'E2' 'A3' 76
6 'acg' 'T' 'Thr' ' ' 4 1328 'E2' 'A3' 76
7 'act' 'T' 'Thr' ' ' 3 1328 'E2' 'A3' 76
8 'aga' 'R' 'Arg' 'bottom' 3 591 'D1' 'G1' 62
9 'agc' 'S' 'Ser' 'teta' 1 1773 'A2' 'D3' 81
10 'agg' 'R' 'Arg' 'bottom' 1 591 'D1' 'G1' 62
11 'agt' 'S' 'Ser' 'teta' 3 1773 'A2' 'D3' 81
12 'ata' 'I' 'Ile' ' ' 2 1054 'C2' 'F2' 72
13 'atc' 'I' 'Ile' ' ' 1 1054 'C2' 'F2' 72
14 'atg' 'M' 'Met' ' ' 1 790 'G2' 'C3' 67
15 'att' 'I' 'Ile' ' ' 3 1054 'C2' 'F2' 72
16 'caa' 'Q' 'Gln' ' ' 3 790 'G2' 'C3' 67
17 'cac' 'H' 'His' ' ' 1 887 'A1' 'D2' 69
18 'cag' 'Q' 'Gln' ' ' 1 790 'G2' 'C3' 67
19 'cat' 'H' 'His' ' ' 3 887 'A1' 'D2' 69
20 'cca' 'P' 'Pro' ' ' 2 3546 'A4' 'D5' 93
21 'ccc' 'P' 'Pro' ' ' 1 3546 'A4' 'D5' 93
22 'ccg' 'P' 'Pro' ' ' 4 3546 'A4' 'D5' 93
23 'cct' 'P' 'Pro' ' ' 3 3546 'A4' 'D5' 93
24 'cga' 'R' 'Arg' 'top' 2 591 'D1' 'G1' 62
25 'cgc' 'R' 'Arg' 'top' 1 591 'D1' 'G1' 62
26 'cgg' 'R' 'Arg' 'top' 4 591 'D1' 'G1' 62
27 'cgt' 'R' 'Arg' 'top' 3 591 'D1' 'G1' 62
28 'cta' 'L' 'Leu' 'lambda' 2 995 'H1' 'E2' 71
29 'ctc' 'L' 'Leu' 'lambda' 1 995 'H1' 'E2' 71
30 'ctg' 'L' 'Leu' 'lambda' 4 995 'H1' 'E2' 71
31 'ctt' 'L' 'Leu' 'lambda' 3 995 'H1' 'E2' 71
32 'gaa' 'E' 'Glu' ' ' 3 790 'G2' 'C3' 67
33 'gac' 'D' 'Asp' ' ' 1 995 'H1' 'E2' 71
34 'gag' 'E' 'Glu' ' ' 1 790 'G2' 'C3' 67
35 'gat' 'D' 'Asp' ' ' 3 995 'H1' 'E2' 71
36 'gca' 'A' 'Ala' ' ' 2 3546 'A4' 'D5' 93
37 'gcc' 'A' 'Ala' ' ' 1 3546 'A4' 'D5' 93
38 'gcg' 'A' 'Ala' ' ' 4 3546 'A4' 'D5' 93
39 'gct' 'A' 'Ala' ' ' 3 3546 'A4' 'D5' 93
40 'gga' 'G' 'Gly' ' ' 2 395 'G0' 'C1' 55
41 'ggc' 'G' 'Gly' ' ' 1 395 'G0' 'C1' 55
42 'ggg' 'G' 'Gly' ' ' 4 395 'G0' 'C1' 55
43 'ggt' 'G' 'Gly' ' ' 3 395 'G0' 'C1' 55
44 'gta' 'V' 'Val' ' ' 2 1579 'G2' 'C3' 79
45 'gtc' 'V' 'Val' ' ' 1 1579 'G2' 'C3' 79
46 'gtg' 'V' 'Val' ' ' 4 1579 'G2' 'C3' 79
47 'gtt' 'V' 'Val' ' ' 3 1579 'G2' 'C3' 79
48 'taa' ' ' 'TKD' ' ' 0 0 ' ' ' ' 115
49 'tac' 'Y' 'Tyr' ' ' 1 591 'D1' 'G1' 62
50 'tag' ' ' 'TKD' ' ' 0 0 ' ' ' ' 115
51 'tat' 'Y' 'Tyr' ' ' 3 591 'D1' 'G1' 62
52 'tca' 'S' 'Ser' 'lambda' 2 1773 'A2' 'D3' 81
53 'tcc' 'S' 'Ser' 'lambda' 1 1773 'A2' 'D3' 81
54 'tcg' 'S' 'Ser' 'lambda' 4 1773 'A2' 'D3' 81
55 'tct' 'S' 'Ser' 'lambda' 3 1773 'A2' 'D3' 81
56 'tga' ' ' 'TKD' ' ' 0 0 ' ' ' ' 115
57 'tgc' 'C' 'Cys' ' ' 1 1328 'E2' 'A3' 76
58 'tgg' 'W' 'Trp' ' ' 1 591 'D1' 'G1' 62
59 'tgt' 'C' 'Cys' ' ' 3 1328 'E2' 'A3' 76
60 'tta' 'L' 'Leu' 'teta' 3 995 'H1' 'E2' 71
61 'ttc' 'F' 'Phe' ' ' 1 790 'G2' 'C3' 67
62 'ttg' 'L' 'Leu' 'teta' 1 995 'H1' 'E2' 71
63 'ttt' 'F' 'Phe' ' ' 3 790 'G2' 'C3' 67
[31.03.2017 23:13:37] Кушелев Александр Юрьевич: Мы же договаривались эту таблицу сделать внешним файлом, чтобы можно было редактировать
[31.03.2017 23:13:55] Кушелев Александр Юрьевич: Да. Эту самую
[31.03.2017 23:14:00] Va12220(Valqwa): нет. про это не договаривались пока что
[31.03.2017 23:14:18] Va12220(Valqwa): ну и что в этой таблице ты хочешь менять добавлять ?
[31.03.2017 23:14:27] Кушелев Александр Юрьевич: А ты можешь в эту таблицу добавить номер инструмента и длительность ноты?
[31.03.2017 23:14:41] Кушелев Александр Юрьевич: И сделать, чтобы эту таблицу можно было менять в папке?
[31.03.2017 23:14:50] Va12220(Valqwa): последний столбик и есть номер инструимента что ты мне ранее дал
[31.03.2017 23:14:56] Кушелев Александр Юрьевич: Да
[31.03.2017 23:15:04] Кушелев Александр Юрьевич: А длительность нужно сделать ещё столбик
[31.03.2017 23:15:10] Кушелев Александр Юрьевич: И инструмент ещё столбик
[31.03.2017 23:15:17] Va12220(Valqwa): а длительность ноты сюда в принципе добавить невозможно, поскольку она привязана к композитному коду
[31.03.2017 23:15:30] Кушелев Александр Юрьевич: Так мы её отвяжем.
[31.03.2017 23:15:39] Кушелев Александр Юрьевич: Мне же таблицу менять нужно будет
[31.03.2017 23:15:59] Кушелев Александр Юрьевич: Я хочу экспериментировать с разными инструментами и длительностями
[31.03.2017 23:16:20] Va12220(Valqwa): ты какой-то непоследовательный.
так программу не написать.

и так - длительность ноты - твое первое заявление - зависит от композитного кода
[31.03.2017 23:16:35] Кушелев Александр Юрьевич: Я передумал
[31.03.2017 23:16:42] Кушелев Александр Юрьевич: Пусть длительность задаётся таблицей
[31.03.2017 23:16:43] Va12220(Valqwa): инструменты потом будем обсуждать. мы ещё не сдвинулись в правиле в самом начале.
[31.03.2017 23:16:56] Va12220(Valqwa): какой таблицей пусть задается длительность?
[31.03.2017 23:17:00] Кушелев Александр Юрьевич: Инструменты тоже таблицей
[31.03.2017 23:17:14] Кушелев Александр Юрьевич: Дополнительным столбцом к старой таблице
[31.03.2017 23:17:39] Va12220(Valqwa): не может длительность к старой таблице быть привязана, поскольку она привязана к композитному коду
[31.03.2017 23:17:50] Кушелев Александр Юрьевич: Отвяжи
[31.03.2017 23:18:08] Кушелев Александр Юрьевич: Добавь в таблице длительность и сделай пока такой же, как была
[31.03.2017 23:18:18] Va12220(Valqwa): ты же потом начнешь её привязывать? я так не умею. то привяжи то отвяжи
[31.03.2017 23:18:26] Кушелев Александр Юрьевич: Одинаковой для всех нот, скажем, 0.125 сек
[31.03.2017 23:18:35] Кушелев Александр Юрьевич: Не буду я её привязывать
[31.03.2017 23:18:38] Va12220(Valqwa): а композитный код ?
[31.03.2017 23:18:42] Кушелев Александр Юрьевич: Таблично задать и дело с концом
[31.03.2017 23:19:03] Кушелев Александр Юрьевич: Я в одной таблице задам одинаковую, а в другой таблице (сменной) задам разную
[31.03.2017 23:19:08] Кушелев Александр Юрьевич: Буду таблицы менять
[31.03.2017 23:19:16] Va12220(Valqwa): о! а что такое ДРУГАЯ таблица?
[31.03.2017 23:19:35] Кушелев Александр Юрьевич: Второй экземпляр, как второй набор "кирпичей"
[31.03.2017 23:19:45] Va12220(Valqwa): а композитный код ? не учитывать ?
[31.03.2017 23:19:59] Кушелев Александр Юрьевич: Не учитывать
[31.03.2017 23:20:37] Va12220(Valqwa): а инструмент
объясни что такое с точки зрения миди инструмент РОЯЛЬ
[31.03.2017 23:21:09] Кушелев Александр Юрьевич: Я так понял, что можно задать номер инструмента. 000 - рояль
[31.03.2017 23:21:37] Va12220(Valqwa): где это ты вычитал и понял ?
[31.03.2017 23:21:53] Кушелев Александр Юрьевич: А ударные идут кажется после 100-го номера. Но там 16 каналов миди. Каждому нужно присваивать номер от 000 до ...
[31.03.2017 23:22:35] Кушелев Александр Юрьевич: У меня на синтезаторе 99 инструментов. А каналов миди 16
[31.03.2017 23:22:37] Va12220(Valqwa): программа по словам "кажется" и "где-то можно задать инструмент 000 как рояль" не пишется
[31.03.2017 23:22:55] Кушелев Александр Юрьевич: Надо читать описание миди-стандарта
[31.03.2017 23:23:07] Va12220(Valqwa): ну и наигрывай по триплетам у себя на инструменте )
[31.03.2017 23:23:10] Кушелев Александр Юрьевич: Ты же показывал таблицу, где были номера нот и кажется каналов миди
[31.03.2017 23:23:27] Va12220(Valqwa):
1 --- начало (удары)
2 --- продолжительность (удары)
3 --- канал midi
4 --- подача midi
5 --- скорость
6 --- начало (секунда)
7 --- продолжительность (секунда)

[31.03.2017 23:23:30] Кушелев Александр Юрьевич: А как присваивать каналам номера инструментов я не знаю
[31.03.2017 23:23:43] Кушелев Александр Юрьевич: 3 - канал миди. Это оно
[31.03.2017 23:24:08] Va12220(Valqwa): всего ты говоришь 16 каналов
[31.03.2017 23:24:24] Кушелев Александр Юрьевич: Рояль там может быть на нулевом канале по умолчанию
[31.03.2017 23:24:31] Кушелев Александр Юрьевич: А с барабаном фокус может не пройти
[31.03.2017 23:24:37] Va12220(Valqwa): где там ? в таблице ?
[31.03.2017 23:24:46] Кушелев Александр Юрьевич: В миди-данных
[31.03.2017 23:27:04] Va12220(Valqwa): да ужж ) не зря от тебя савин с неделько ушли )
[31.03.2017 23:27:19] Кушелев Александр Юрьевич: А в таблице можно задать номер канала миди, учитывая, что нулевой канал - рояль, первый канал - барабан, второй - маракас
[31.03.2017 23:28:26] Кушелев Александр Юрьевич: 63 'ttt' 'F' 'Phe' ' ' 3 790 'G2' 'C3' 67добавь туда номер канала миди и длительность в секундах
[01.04.2017 9:56:41] Кушелев Александр Юрьевич: Привет! Когда пришлёшь волшебную программу, которая сохраняет ещё и dne ?
[01.04.2017 17:51:05] Кушелев Александр Юрьевич: Ау! Наверное, опять на дачу уехал...
[01.04.2017 21:17:11] Va12220(Valqwa): уехал. но вернулся уже
[01.04.2017 21:17:16] Va12220(Valqwa): а ты где ?
[01.04.2017 21:21:04] Кушелев Александр Юрьевич: тут
[01.04.2017 21:21:29] Кушелев Александр Юрьевич: Нужна прога с конвертером фаста-dne
[01.04.2017 21:22:01] Va12220(Valqwa): могу сейчас сделать и выслать
я сейчас поковыряюсь и сделаю ещё вариант когда она не только фасту в dne-кушелеф преобразует а и остальные (ембл и genbank)
[01.04.2017 21:23:02] Кушелев Александр Юрьевич: Ура!
[02.04.2017 0:06:29] Va12220(Valqwa): держи. тут просчет без создания картинок, т.е. быстрый 4, 6 коды, Html и dne

не знаю почему но бывают файлы у которых цепочки "странные, незаконченные или ещё каки-то такие", и тогда программа может выдать ошибку
[02.04.2017 0:08:01] Va12220(Valqwa): проверь
[02.04.2017 1:59:50] Кушелев Александр Юрьевич: Благодарю! А можешь ещё прислать вариант с созданием картинок?
[02.04.2017 2:02:36] Кушелев Александр Юрьевич: Ещё актуально выводить картинки, соответствующие html-файлу:

[02.04.2017 2:03:08] Кушелев Александр Юрьевич:

[02.04.2017 2:03:42] Кушелев Александр Юрьевич:

[02.04.2017 2:04:12] Кушелев Александр Юрьевич: Пока мне приходится делать их через принт скрин и фотошоп
[02.04.2017 9:27:00] Кушелев Александр Юрьевич: Привет! 7-я версия выдаёт неправильный html-файл. После терминирующего кодона ещё довесок. Его надо убрать...
[02.04.2017 9:34:20] Кушелев Александр Юрьевич: А что это за dne-файл без перехода на новую строку?
[02.04.2017 9:36:16] Кушелев Александр Юрьевич: "бывают файлы у которых цепочки "странные, незаконченные или ещё каки-то такие", и тогда программа может выдать ошибку"
Кушелев: А почему 6-я версия отрабатывает те же файлы без ошибок?
[02.04.2017 9:37:44] Кушелев Александр Юрьевич: Если встроить fasta-dne конвертер в общую программу не удаётся, то пришли пока отдельный конвертер. Чтобы вручную не лопатить dne-файлы.
[02.04.2017 11:40:53] Va12220(Valqwa): все. теперь до четвега меня не будет. уезжаю.
[02.04.2017 11:52:18] Кушелев Александр Юрьевич: Жаль. Придётся дальше вручную лопатить фасту в dne
[02.04.2017 11:53:36] Кушелев Александр Юрьевич: А до этого ты мне присылал нормальный dne-файл...
[04.04.2017 8:30:49] Кушелев Александр Юрьевич: Вот такой файл сможешь корректно обработать? https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/565306521
[06.04.2017 21:16:22] Кушелев Александр Юрьевич: Привет! Я нашёл способ анализа целых геномов! Но для удобства нужно будет выводить ещё один html-файл, где цветом отмечены не единичные символы аминокислот, а входные триплеты. Выводить нужно будет не G(Gly), а GGC(код глицина). Твоя прога действительно стала работать в сотни раз быстрее. Ещё меня порадовало, что она смогла сохранить html-файлы размером по 18 мегабайт. А нужно будет ещё раз в 10 больше.
[06.04.2017 22:20:00] Va12220(Valqwa): саша привет
я вернулся. так что можем продолжить
[06.04.2017 22:20:39] Кушелев Александр Юрьевич:

[06.04.2017 22:21:12] Кушелев Александр Юрьевич: Можешь вывести ещё один файл html, в котором вместо символа аминокислоты будет триплет
[06.04.2017 22:21:17] Va12220(Valqwa): а что даст вывод цветом триплетов ?
[06.04.2017 22:22:28] Кушелев Александр Юрьевич: Я смогу прямо из html-файла брать кусок кода в буфер обмена данными и запускать поиск белка по нуклеотидной последовательности или твою программу, чтобы она показывала уже именно расчёт по данному фрагменту.
[06.04.2017 22:22:44] Кушелев Александр Юрьевич: По аминокислотной последовательности сложнее.
[06.04.2017 22:23:27] Кушелев Александр Юрьевич: И ещё актуально исправить вывод dne-файла. Там нет переносов строк
[06.04.2017 22:23:31] Va12220(Valqwa): согласен. так естественнеей и вернее
[06.04.2017 22:24:52] Va12220(Valqwa): вывод дне - вставить перенос строк
посмотрю не помню как я ранее это делал, но делал.

тогда я сейчас делаю вариант где выводятся последовательности 4 и 6
дне
html1
и добавлю html3

картинку пока что за"комментирую" - не будет выводиться
[06.04.2017 22:25:39] Кушелев Александр Юрьевич: Ты сможешь сделать онлайн-сервис или лучше чтобы этим занимались программисты, которые специализируются именно на онлайн-режиме?
[06.04.2017 22:26:35] Кушелев Александр Юрьевич: html с триплетами лучше назвать так же, но добавить в конце имени знак подчёркивания
[06.04.2017 22:27:37] Кушелев Александр Юрьевич: Для работы с геномами картинка будет не нужна, но для работы с короткими файлами нужен будет вариант с картинкой
[06.04.2017 22:27:45] Va12220(Valqwa): хорошо.
онлайн - это надо дополнительно разбираться.
в принципе могу. но хватило бы денег на покушать и времени
[06.04.2017 22:28:16] Кушелев Александр Юрьевич: Если Перспективный инвестор оплатит работу по созданию онлайн-сервиса, то возьмёшься?
[06.04.2017 22:28:19] Va12220(Valqwa): сделаю 2 варианта одинаковых - с картинкой и без.
[06.04.2017 22:28:23] Кушелев Александр Юрьевич: ОК
[06.04.2017 22:29:15] Кушелев Александр Юрьевич: Онлайн-сервис может вывести на коммерческие рельсы...
[06.04.2017 22:29:57] Va12220(Valqwa): думаю да, если сможем с тобой разобраться в твоих умозаключениях по теме эфир и все что с ним связано, перевести твои мыслеформы в понятный язык и есть тогда возможность запустить это все быстрее, чем через поиск верующих адептов в СВЕТЛОЕ (от слова ЛАМПОЧКА) будущее
[06.04.2017 22:31:17] Кушелев Александр Юрьевич: ОК! Ты через сколько планируешь сделать версию с выводом html, triplet-html и dne?
[06.04.2017 22:31:31] Va12220(Valqwa): я планировал в пн к тебе, но не могу теперь уже.
а надо почаще. раза два в неделю тебя теребить
[06.04.2017 22:31:38] Va12220(Valqwa): сейчас приступлю
[06.04.2017 22:32:20] Va12220(Valqwa): по поводу ОНЛАЙНА - откладываю в закладки. мы ещё не закончилли то что есть
[06.04.2017 22:32:27] Кушелев Александр Юрьевич: ОК!
[06.04.2017 22:33:02] Va12220(Valqwa): но я надеюсь - заканчиваем.

с мидиками - немного притормозилось. не сохраняет правильно полученный мидик у мея пока что программа. разбираюсь
[06.04.2017 22:33:44] Кушелев Александр Юрьевич: Мне в первую очередь нужна версия, которая сохраняет dne
[06.04.2017 22:33:58] Кушелев Александр Юрьевич: Во вторую - triplet-html
[06.04.2017 22:34:03] Кушелев Александр Юрьевич: А миди в третью
[06.04.2017 22:34:40] Va12220(Valqwa): сейчас ЛЮБАЯ версия сохраняет дне. дне добавлено как класс. я не могу писать для каждого случая отдельную программу. запутаюсь и пойдут ошибки.
все в одном флаконе делается
[06.04.2017 22:34:53] Кушелев Александр Юрьевич: Геномы весят по 20-30 мегабайт (текст)
[06.04.2017 22:35:10] Кушелев Александр Юрьевич: dne пока неправильно сохраняется. Нет переноса строк
[06.04.2017 22:35:50] Va12220(Valqwa): ну и что

это 4 и 6 - быстро
это дне быстро
это тоже быстро html1 html3
[06.04.2017 22:35:56] Va12220(Valqwa): исправлю сейчас
[06.04.2017 22:35:59] Кушелев Александр Юрьевич: ОК
[06.04.2017 22:40:17] Кушелев Александр Юрьевич: В triplet-html верхняя строчка должна остаться от фасты.
[07.04.2017 0:22:54 | Изменены 0:22:55] Va12220(Valqwa): проверь dne
каким редактором открываешь его?
[07.04.2017 1:06:47] Кушелев Александр Юрьевич: Небольшой файл triplet-html отрабатывает нормально, а большой нет.
[07.04.2017 1:07:04] Кушелев Александр Юрьевич: Видимо какой-то буфер маловат...
[07.04.2017 1:07:27] Кушелев Александр Юрьевич: А односимвольный html нормально отрабатывает большой файл.
[07.04.2017 1:08:22] Кушелев Александр Юрьевич: И dne-файл по большой фасте не делается.
[07.04.2017 1:08:46] Кушелев Александр Юрьевич: Но dne больших файлов мне и не нужны
[07.04.2017 1:09:38] Кушелев Александр Юрьевич: Можно даже сделать проверку на размер файла. Если он больше 10 килобайт, то dne-файл делать не нужно.
[07.04.2017 1:09:59] Кушелев Александр Юрьевич: А triplеt-html нужно...
[07.04.2017 1:10:38] Кушелев Александр Юрьевич: Но на мелких файлах вроде всё работает идеально.
[07.04.2017 1:16:25] Кушелев Александр Юрьевич: Не, на маленьких файлах тоже неправильно работает трёхсимвольный
[07.04.2017 1:17:11] Кушелев Александр Юрьевич: Один и тот же триплет повторяется по всему файлу. А должны быть все триплеты разные...
[07.04.2017 1:17:47] Кушелев Александр Юрьевич: Так что на большом файле та же ошибка, что и на маленьком. От размера файла не зависит.
[07.04.2017 9:55:29] Va12220(Valqwa): ясно. вышли файлы на кторых ошибки
проверю
[07.04.2017 10:00:19] Кушелев Александр Юрьевич: Так уже
[07.04.2017 10:01:05] Кушелев Александр Юрьевич: OLQ.fasta
[07.04.2017 10:02:33] Va12220(Valqwa): хорошо.
[07.04.2017 10:02:38] Va12220(Valqwa): дне нормально ?
[07.04.2017 10:02:57] Кушелев Александр Юрьевич: Да!
[07.04.2017 10:03:46] Va12220(Valqwa): вижу. разберусь
[07.04.2017 10:04:21] Кушелев Александр Юрьевич: ОК!
[07.04.2017 16:17:31] Кушелев Александр Юрьевич: Привет!
[07.04.2017 18:41:16] Va12220(Valqwa): привет. я дома. могу наконец то далее продолжить
[07.04.2017 19:57:50] Кушелев Александр Юрьевич: Ура!
[07.04.2017 20:38:49] Кушелев Александр Юрьевич: Можешь сохранить на жёсткий диск копии выпусков рассылки "Новости лаборатории Наномир" с 593-го по 599-ый? У меня все браузеры не могут...
[07.04.2017 20:52:04] Va12220(Valqwa): погоди. немного занят. поужинай пока что
[07.04.2017 20:52:24] Va12220(Valqwa): и объясни что такое "сохранить копии выпусков..."
[07.04.2017 20:54:19] Кушелев Александр Юрьевич: Заходишь в архив рассылки, нажимаешь в браузере "сохранить как" и сохраняешь выпуск на жесткий диск, чтобы потом добавить в копию архива рассылки, как ты делал раньше.
[07.04.2017 20:54:45] Кушелев Александр Юрьевич: Я уже не могу банально сохранить страницу на жёсткий диск. Что-то с браузерами или компом или виндами
[07.04.2017 21:57:16] Va12220(Valqwa): я исправил вывод триплета. индекс не поменял при копировании. ночью усталость...
сейчас проверяю. но дооолго выводится (( надо будет соптимизировать
[07.04.2017 21:57:56] Кушелев Александр Юрьевич: Ты присылай, что есть, а пока ты будешь оптимизировать, я уже буду с короткими файлами работать.
[07.04.2017 21:59:28] Va12220(Valqwa): оно ?
[07.04.2017 22:00:04] Va12220(Valqwa): только в такой длинной последовательности происходит пока что мне непоянтгыый сбой при преобразовании фасты в твой вид ДНЕ
[07.04.2017 22:02:50] Кушелев Александр Юрьевич: Да, вроде нормально. Присылай прогу
[07.04.2017 22:02:59] Va12220(Valqwa): 5 мин. скомпилирую
[07.04.2017 22:03:02] Кушелев Александр Юрьевич: ОК
[07.04.2017 22:15:49] Кушелев Александр Юрьевич: Благодарю! Сейчас буду пробовать...
[07.04.2017 22:30:02] Кушелев Александр Юрьевич: А почему твоя прога по твоему же dne-файлу не хочет работать?
[07.04.2017 22:34:06] Va12220(Valqwa): вот я сейчас сижу разбираюсь.
я использовал штатные функции языка программирования.
и она как оказалось на этих длиннющих цепочках сбоит.
мне прост было некогда перед отъездом заниматься и писать свою функцию.
вот поковырялся.... придется написать свою
[07.04.2017 22:34:33] Va12220(Valqwa): я про преобразование фасты в дне
а ты про что ?
[07.04.2017 22:35:46] Кушелев Александр Юрьевич: Твоя прога сохранила dne-файл. Он правильный. Все программы его берут и показывают правильную структуру. Твоя прога файл dne не берёт, т.е. не обрабатывает. Как будто его нет. А фасту обрабатывает.
[07.04.2017 22:36:08] Va12220(Valqwa): моя прога ТВОЙ РАННИЙ вариант ДНЕ не умеет брать (пока что )
[07.04.2017 22:36:16] Кушелев Александр Юрьевич: А мне нужно, чтобы твоя прога тоже понимала dne-файлы
[07.04.2017 22:36:31] Кушелев Александр Юрьевич: Он стандартный
[07.04.2017 22:36:55] Va12220(Valqwa): саша - ну я конечно написанием программ занимаюсь давно. и для тебя пишу в целом быстро. больше не пишу а пью чай кофе и поглощаю вкусности))
но все ж я не электровеник
[07.04.2017 22:38:01] Кушелев Александр Юрьевич: Странно, что твоя прога фасту берёт, а те же символы в виде dne не берёт
[07.04.2017 22:38:13] Кушелев Александр Юрьевич: Ну ладно, это не к спеху
[07.04.2017 22:38:39] Va12220(Valqwa): отсутствует модуль чтения ТВОЕГО ДНЕ
а сохранять это просто
[07.04.2017 22:41:02] Кушелев Александр Юрьевич: Ты же говорил, что твоя прога может читать не только фасту
[07.04.2017 22:41:03] Va12220(Valqwa): пойду чаю попью.
в каком формате тебе сохранить твои 593-го по 599-ый?
а то ты как обычно не сказал.
[07.04.2017 22:41:33] Va12220(Valqwa): но ты подставляй не свою самодельную дне. а ембл - ту которая на сайте
[07.04.2017 22:41:41] Кушелев Александр Юрьевич: В таком же, как и раньше, чтобы залить сюда: http://nanoworld88.narod.ru/data/index.htm
[07.04.2017 22:41:44] Va12220(Valqwa): невнимательно ты меня слушаешь. я же писал )
[07.04.2017 22:42:00] Va12220(Valqwa): ты сам туда потом зальёшь ?
[07.04.2017 22:42:01] Кушелев Александр Юрьевич: На сайте есть точно такие же, как делает твоя прога
[07.04.2017 22:42:16] Кушелев Александр Юрьевич: Лучше ты. Я что-то уже не могу туда заливать.
[07.04.2017 22:42:20] Va12220(Valqwa): ниче не понимаю. где есть. что есть. как делает. что делает )
[07.04.2017 22:42:35] Кушелев Александр Юрьевич: Может ты когда заедешь, настроишь комп. Тогда смогу
[07.04.2017 22:42:37] Va12220(Valqwa): так и скажи - обнови сайт 88й )
[07.04.2017 22:43:10] Кушелев Александр Юрьевич: Обновить ещё лучше. Но хотя бы сохранить последние выпуски, чтобы не пропали
[07.04.2017 22:43:45] Кушелев Александр Юрьевич: Твоя прога сейчас делает нормальные dne-файлы. Такие же есть на сайте EMBL
[07.04.2017 22:44:20] Кушелев Александр Юрьевич: И мне непонятно, почему она их не может читать. А у тебя есть файл dne, который твоя прога может прочесть?
[07.04.2017 23:11:12] Va12220(Valqwa): нету )
[07.04.2017 23:28:02] Va12220(Valqwa): ладно. остановимся. я сейчас 88й сайт заполню
[0:00:01] Va12220(Valqwa): я смотрю ты там во всю ивановскую уже делаешь открытия благодаря програмке что сейчас разрабатываем.
упоминай меня периодически ) если можно
[1:06:46] Кушелев Александр Юрьевич: "Сам себя не похвалишь..." А ты сам на форуме зарегистрирован. Хвали хоть каждый час с помощью компьютерного бота
[1:07:10] Va12220(Valqwa): некогда
[1:07:31] Кушелев Александр Юрьевич: Я же выкладываю скайп-переписку, поэтому те, кто форум читают, в курсе, кто пишет программы
[1:08:06] Кушелев Александр Юрьевич: Ты там ещё в программе впиши свою фамилию, чтобы она "маячила"
[1:08:41] Va12220(Valqwa): при выводе картинок ? )
[1:08:45] Кушелев Александр Юрьевич: А программа действительно помогает делать научные открытия ежедневно.
[1:08:56] Кушелев Александр Юрьевич: Да при выводе чего угодно.
[1:08:58] Va12220(Valqwa): я это заметил
[1:09:26] Кушелев Александр Юрьевич: Кстати, ты можешь ещё выводить файл, который как бы принт-скрин html-файлов?
[1:09:32] Va12220(Valqwa): что-то 88й сайт сейчас клинит. связь рвется.
остаток файлов рассылки я закину туда завтра
[1:09:48] Кушелев Александр Юрьевич: А то приходится их перетаскивать в графическую форму через фотошоп
[1:09:58] Кушелев Александр Юрьевич: ОК
[1:09:59] Va12220(Valqwa): я много чего могу. но все требует времени. а потому сейчас спать

2017.04/08 11:37:52

Формы, механизмы, энергия наномира. Сообщение 86 973

Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 2

Музыка добелкового мира. 50 000 000 000 000 лет назад

Skype, 2017-04-08:

[11:23:58] Va12220(Valqwa): Саша, продолжить сможем в воскресенье к вечеру.
[11:25:21] Кушелев Александр Юрьевич: Ура!
[11:25:31] Кушелев Александр Юрьевич: Теперь на очереди МИДИ
[11:27:10] Va12220(Valqwa): на самом деле
- оптимизировать вывод html и html3 - долговато на мой взгляд
- дописать чтение dne
- миди
и её что-то
[11:28:12] Кушелев Александр Юрьевич: ОК
[11:28:18] Кушелев Александр Юрьевич: Видел, что творится?
[11:29:12] Кушелев Александр Юрьевич: Так что миди желательно сделать, как и в случае с triplet-html два варианта. Белковую и ДНК
[11:30:18] Кушелев Александр Юрьевич: Сначала сборка ДНК звучит по-своему. Потом процесс транскрипции ДНК -> РНК звучит на полтона ниже, причём комплементарно (надо уточнить, с реверсом или нет?) А потом уже звучит музыка процесса трансляции (сборки белка)
[11:34:02] Кушелев Александр Юрьевич: Интересно сохранить миди-2, где сначала звучит сборка ДНК, потом процесс транскрипции, а потом уже сборка белка. Но это для второй версии.

2017.04.08 11:37:52

Музыка добелкового мира. 50 000 000 000 000 лет назад

Skype, 2017-04-08:

2017.04.08 13:53:27

Письмо Дидье Маруани / Didier Marouani от Кушелева

Complement-reverse-midi-converter

[13:46:02] Кушелев Александр Юрьевич: Кстати по поводу "и ещё что-то". Есть идея сделать complement-reverse-midi-converter
Алгоритм очень простой. Нужно заменить ноты с номерами MIDI n на ноты с номерами MIDI 140-n
А во второй версии добавить возможность проигрывания наоборот, т.е. ноты с порядковым номером n заменить на ноты с порядковым номером N-n

Letter to Didier:

Hello, Didier! I have new idea:
Complement-reverse-midi-converter
The algorithm is very simple. It is necessary to replace notes with MIDI-numbers n to notes with MIDI-numbers 140-n
And in the second version to add the ability to play the opposite, i.e. Notes with the serial number n are replaced by notes with the serial number N-n
Warm wishes,
Your Alexander Kushelev

2017.04.26 19:00:52

Создаём программу Complement MIDI converter

[23.04.2017 12:04:04] Кушелев Александр Юрьевич: Привет!
[23.04.2017 12:04:24] Кушелев Александр Юрьевич: Я тут обнаружил странную ошибку в проге. Вот этот геном: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/292397674
[23.04.2017 12:04:52] Кушелев Александр Юрьевич: Обрабатывается таким образом, что html не показывает чёрные элементы, а ftml-3 показывает.
[23.04.2017 12:06:49] Кушелев Александр Юрьевич: Здесь результаты обработки: https://cloud.mail.ru/public/Lj7t/PUB46Mcqx
[24.04.2017 11:26:19] Va12220(Valqwa): понял. смотрю
[24.04.2017 12:54:43] Кушелев Александр Юрьевич: Меня срочнее интересует обработка подпапок и графические образы html-файлов. Вручную лопатить не камильфо...
[24.04.2017 12:55:10] Va12220(Valqwa): планирую в среду поутру к тебе. будешь дома ? Нет планов не быть дома ?
[24.04.2017 12:55:34] Va12220(Valqwa): рвут меня рвут на части. Не смог в выходные приступить к программе
[24.04.2017 12:55:36] Кушелев Александр Юрьевич: Пока вроде дома должен быть
[24.04.2017 12:57:42] Va12220(Valqwa): Гуд. хорошо. ну а потом на майских ещё в планах тебя подергать за извилину.
[24.04.2017 12:58:20] Va12220(Valqwa): Активный член форума "Татьяна" так и не ответила мне в скайпе. она наверное в форуме сама с собой общается.
[24.04.2017 12:58:39] Кушелев Александр Юрьевич: Может не заметила
[24.04.2017 13:02:07] Va12220(Valqwa): А жаль. Вопрос к ней связан с привлечением её к варианту возглавить получение финансов для проекта Рубиновая энергетика и Пико2017 от *****.
[24.04.2017 13:04:57] Кушелев Александр Юрьевич: Она форум читает. В скайпе, как я понял, она не работает
[24.04.2017 13:24:28] Va12220(Valqwa): без слов
[24.04.2017 13:28:15] Кушелев Александр Юрьевич: А ты, если доделаешь прогу и будет время, можешь послушать 6 мелодий в музыкальном размере 7/8, которые закодированы одной нуклеотидной последовательностью
[24.04.2017 19:25:51] Кушелев Александр Юрьевич: Привет! А твоя программа сможет обработать весь этот геном? https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/75 … W6YTK2A01R
[24.04.2017 19:26:30] Кушелев Александр Юрьевич: Мне нужно получить корректный html-файл, а лучше сразу его графический образ
[24.04.2017 19:27:04] Кушелев Александр Юрьевич: И html-3 файл
[24.04.2017 19:56:49] Кушелев Александр Юрьевич: Вот такие геномы интересно обрабатывать на уровне html-файла и графического образа
[24.04.2017 19:56:50] Кушелев Александр Юрьевич: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/508078133#
[25.04.2017 12:57:09] Va12220(Valqwa): саша привет. я проверю сейчас
[25.04.2017 13:01:16] Va12220(Valqwa): первая ссылочка
ORIGIN
1 myarraytkt rtgclqckqr kikcdehkps ccnckrhqss csylqyipvg srpghphpsi
61 lptsqhstqt irsrtpsqls fresspskgl rplpleftil dlellyfytt ttsneilghh
121 ltgthvwqth vvtisfqhtf llyellslaa qhlaflhtas lsqskrylna atlyhlksis
181 tfrnelqnit rensdaccac asllglhawt npggrgsslf fpgqeavess pgsgiawykl
241 hrganeilks nlerirdgql wdmirpwqsi spqavgfefp tplpmeegan ldavaecwvy
301 sdlsiddkla leealqtlrl ifsmvsimdi eisnytails wttimpkrfc emveekypqa
361 lilvavycvl lkrldefwwi rgkaeslmga vkrelpgvwd swlewpsrel dgsaidgegk
421 alvchik
ну совсем странные буковки - с ними надо отдельно "учиться" работать
просто нужны правила. Далее как обычно
[25.04.2017 13:02:05] Va12220(Valqwa): вторая ссылочка - там конечно ГИПЕР большая цепочка
сейчас подгрузится - попробую её "взять" ))
[25.04.2017 13:04:10] Кушелев Александр Юрьевич: 1000 извинений. Там нужно пройти по ссылке: accession KN832874.1: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/751754252
[25.04.2017 13:04:45] Кушелев Александр Юрьевич: И это только часть. Если нажать на ссылку CDS, то предложат загрузить нуклеотидную последовательность. Могу сразу тебе её кинуть в скайпе
[25.04.2017 13:05:01] Va12220(Valqwa): давай
[25.04.2017 13:06:55] Кушелев Александр Юрьевич: Это полные геномы. Мне интересно анализировать их целиком по файлам html, а ещё лучше по их графическим образам
[25.04.2017 13:13:46] Va12220(Valqwa): первый - kind03047 - там 309 тысяч триплетов!
[25.04.2017 13:25:08] Va12220(Valqwa): остальное считается ОЧЕНЬ долго,
я думаю пока что тоже поставить ограничение на размер файла при выводе миди.
[25.04.2017 13:28:53] Va12220(Valqwa): прислать то ты мне файлы прислал. только
[gap 100 bp] Expand Ns
не нажал. все в пустую мегабайты по проводам гоняешь )
[25.04.2017 13:33:51] Кушелев Александр Юрьевич: А я поэтому и прислал тебе ссылку, что сам не могу там сделать Expand. Что-то не срабатывает.
[25.04.2017 13:34:55] Va12220(Valqwa): ясно )
я гружу фасту сразу. там уже все(экпанд)учтено
[25.04.2017 13:35:17] Кушелев Александр Юрьевич: А...
[25.04.2017 13:37:10] Кушелев Александр Юрьевич: Да. Миди придётся ограничить.
[25.04.2017 14:36:15] Кушелев Александр Юрьевич: Что-то длина строчек в html-файле вдруг разная стала. В чём проблема?
[25.04.2017 14:37:18] Va12220(Valqwa): сам удивляюсь )
[25.04.2017 14:37:54] Кушелев Александр Юрьевич: Может шрифт слетел?
[25.04.2017 15:07:47] Кушелев Александр Юрьевич: А сможешь сделать в МИДИ-конвертере округление номеров нот до множества разрешённых номеров? И этот набор разрешённых номеров нужно держать отдельным файлом-таблицей.
[25.04.2017 15:08:05] Кушелев Александр Юрьевич: Точнее, не таблицей, а строкой
[25.04.2017 15:08:13] Кушелев Александр Юрьевич: Или столбцом
[25.04.2017 15:09:05] Кушелев Александр Юрьевич: Столбец разрешённых номеров будет состоять из максимум 12 чисел. Остальные получаются добавлением 12*n
[25.04.2017 15:10:22] Кушелев Александр Юрьевич: Фактически я буду задавать номера разрешённых нот для самой нижней октавы, а остальные будут получаться добавлением 12*(номер октавы-1)
[25.04.2017 15:46:07] Va12220(Valqwa): Могу. Все могу. Я же волшебник.)
но вот матлаб уже не тянет те самые супер последовательности триплетов в которых их сотни тысяч(((
а значит все равно надо переписывать (и побыстрее) все на С
[25.04.2017 15:46:33] Va12220(Valqwa): даже у меня не потянул. А у меня тут компец будь здоров.
[25.04.2017 17:40:00] Кушелев Александр Юрьевич: Можно же разбить на блоки, например, по 100 000 или по 50 000
[8:34:13] Кушелев Александр Юрьевич: Глядя на картинки можно понять, что твоя прога не обнуляет память, поэтому следующая структура накладывается на предыдущую. Если следующая структура короче, то видна "из под пятницы суббота"
[8:53:35] Кушелев Александр Юрьевич: Поэтому приходится вручную перетаскивать из папки в папку фасту, а потом обратно файлы-результаты. Версия подпапочной корректной обработки может сильно сэкономить время.
[18:43:44] Кушелев Александр Юрьевич: Таблица, точнее строка разрешённых нот для complement-midi-converter
1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0 -все 12 нот в каждой октаве разрешены, т.е. получается обычный комплемент.
[18:44:33] Кушелев Александр Юрьевич: На первом месте нота до, на втором - до-диез, на последнем - си.
[18:47:04] Кушелев Александр Юрьевич: 13 цифра - тип округления. 0 - округления нет. 1 - округление до ближайшего верхнего номера, 2 - округление до ближайшено нижнего номера, 3 - округление до ближайшего (верхнего или нижнего. Если оба одинаково близко, то до верхего.) 4 - то же (если оба одинаково близко, то до нижнего).
[18:47:32] Кушелев Александр Юрьевич: Вариант таблицы с разрешёнными белыми клавишами рояля:
[18:49:42] Кушелев Александр Юрьевич: 1,0,1,0,1,1,0,1,0,1,0,1,3 (с округлением до ближайшего верхнего или нижнего. Если одинаково близки, то верхнего).

2017.04.27 2:24:42

[8:26:24] Татьяна Рясина: Здравствуйте, Валентин! Выхожу на связь, про инвестора прочитала в Форуме. Давайте запускать Пикотех. Есть несколько тактических вопросов, напишу на Форуме и продублирую Вам.
[10:02:14] Татьяна Рясина: Если коротко, то обновления Пикотеха проходят раз в месяц. И нужно выпускать обновлёную версию раз в месяц. Т.е. нужно заложить на будущее стоимость программирования обновлений каждый месяц. Также нужны публикации в научных журналах, чтобы ссылаться на них при рассылке писем в НИИ . Хорошо получить лабораторию под Пикотехнологию где дадут. Если без публикаций и без лаборатории - просто крутить Пикотех в интернете и обновлять по плану. А.Ю. написал про версию "с учётом физико-химических взаимодействий" . Получается как HFSS только для белков? Ну и текст с обоснованием Пикотехнологии нужен - описание продукта. Очень краткий, с сутью (мне нужно выдать вариант для отладки на форуме) . Как будет текст, можно выводпть Пикотехнолоию в сеть ))))).
[11:08:31] Татьяна Рясина: Ну и всретиться Вы, А.Ю., инвестор и я если нужно. Просто Вам передают сумму, и Вы делаете продукт. Договариваетесь на следующий транш через месяц (через нужное время). ИМХО дела нужно делать на честном слове. Погуглю всякую там защиту и лицензирование софта и выскажу предложения. Возможно ли лицензировать и защитить Пикотех как софт )))) ???? Тогда вообще можно не возиться с пуликациями в научных журналах. А про лицензирование софта вероятно Вы знаете больше меня )))).
[13:09:01] Va12220(Valqwa): о! Доброго дня. Вчера был у Саши.
Мне, если не сложно и просто потому что не читаю форум регулярно, дублируйте пожалуйста.
остальное:
- "встретиться" - вы в Москве обитаете?
- работа над программой - практически по чуть-чуть изменений но несколько раз в неделею - это и отлов ошибок в реализации алгоритмов, которые(алгоритмы) как Вы, читая форум, видите имеют исключительно словесное описание (как в сказках:) )
это и собственно изменение алгоритмов переписывание на новые "проявившиеся" требования и изменение задачи , хотя слава богу конечная цель(задача) понятна.
- не знаю что такое ИМХО но дела с Сашей мы ведем с самого первого выпуска 2х фильмов в центрнаучфильм. (немножечко пораньше)
- защиту лицензирование софта и т.п. погуглите. сэкономим время.
- тысячу лет ничего не лицензировал, тоже надо будет потом погуглить и разобраться

- публикации в научных журналах - тут два варианта -
1- есть журналы где не нужно разрешение (института) на печать - т.н. экспертное заключение - в таких журналах печатать стараются "быстро" - в тот же месяц или на сл.
2 - не нужно такое заключение - тогда порой можно ждать и пол года на выход статьи.

и главное. Есть ли у Вас время заняться получением денег на исследования и развитие как пикотеха так и рубиновой энергетики через НКО (некоммерческие организации)? Я знаю, что в таких организациях ПРИСУТСТВУЮТ деньги, и они выделяются в том числе и на исследования научные. Эти деньги можно получить. Не завтра, не через месяц, но в течении года можно выйти на их получение. Имеются примеры. При чем если это не Москва, то даже быстрее. Погуглите, попозже, у меня будет время, я смогу более детально прописать что для подобного требуется.
[13:11:10] Va12220(Valqwa): НКО на сегодняшний день для нас единственное место, открытое, с деньгами.
[13:13:47] Va12220(Valqwa): Про инвестора. По моим данным сейчас с нвестором "не айс". Но Пико все равно надо писать и пишу.
Как отдельный вариант рассматриваем создание "онлайн-Пико" с выдачей результатов на сложные белки-цепочки за деньги. Какой бы то ни было, но ручеёк.
[13:14:11] Va12220(Valqwa): какой факультет физтеха вы заканчивали и в каком году? если не секрет
[13:15:12] Va12220(Valqwa): фупм. 1986
[13:23:47] Татьяна Рясина: Фопф 86
[13:24:07] Татьяна Рясина: Вы с ФУПМ'а значит?
[13:24:17] Татьяна Рясина: Это меняет дело ))))

2017.04.2712:29:48

Про деньги и НКО если работает, нужно двигать документы и чего ещё надо, никогда не делала. Времени - постараюсь найти. Нужно по личным связям идти, думаю. Я в Москве. Хорошо уже знакомых инвесторов поднять на 200 000 рублей. Я за неформальные ходы )))))

2017.04.27 13:42:03

Татьяна Рясина: Что проясняется.

По сути по готовности предлагается на обозрение научной общественности и начальству
2D Моделирование Пикотех.

Значит нужно выдать список преимуществ.
На какие результаты можно претендовать имея в руках Пикотех 2D.
Что можно найти посредством Пикотех 2D

Тогда пишем:
3D тоже можем сделать (уже сделали) , но с учётом следующих "но":

В молекулах есть такие-то "узлы", где мы имеем несколько вариантов углов поворота.
Повороты управляются так-то. Влияет на них то-то.

Такие образом
Мы вводим нуклеотидную последовательность
Получаем 2D структуру и музыкальное звучание сборки молекулы

3D версия предлагается как "3D симулятор молекул"
"Полазить" внутри условной молекулы можно, поменять углы поворотов, посмотреть в нескольких масштабах эти молекулы.

Если мы включаем режим 3D, то мы получаем
симулятор молекулы
или
программируемую архитектуру белков,
в котором
меняем такой-то набор параметров, а экранчик нам выдаёт соответствующие изменениям формы молекулы
Углы в таких-то узлах варьируются так-то, по таким-то правилам.
Мостики замыкаются так-то так-то.

(Кстати, а можно сделать программу, которая виртуально кристаллизует белок и показывает рентгенграмму ????? )))))) Т.е. сделать симулятор РСА )))))

Можно включить режимы 4D - "самокруток" вручную.

В 3D MAX можно крутить разные изображения.
А в Пикотехе крутятся части и звенья изображений относительно друг друга.

Шоколадно было бы включить возможность крутить "самокрутки" 4D структур белков, т.е. укладывать их в разных вариантах - т.к. 4D структуры можно видеть под АСМ. Далее идёт сопоставление компьютерных данных и АСМ. Но это уже программа исследований. Выбрать, какие модели моделируются - при том так, чтобы можно было их проверить на АСМ.

В любом случае нужно чтобы у разных учёных произошло некоторое свыкание с Пикотехом в течение некоторого времени. От версии к версии. На эту первую версию. нужны стартовые 200 000 рулей.

В МФТИ программы исследований спускаются или сильно в большой высоты "сверху", т.е. с Запада. Или есть возможность включить своё направление, т.к. МФТИ получает частные пожертвования на месте в России. Тогда есть смысл говорить напрямую с дарителями МФТИ, которые наполняют его фонд. И учреждать лабораторию.

Компьютерное моделирование белков я смотрела - тема популярная. В Пущино есть целый институт по математическому моделированию белков.

Или брать у частного инвестора 200 000 и делать максимум функций в симуляторе молекул какой только можно. Потянул мышкой - угол изменился, счётчик показал значение угла. и т.д.
Распределение полей, оболочек и чего-то ещё.

Чтобы молекула можно было "резать" (если нужно" или что-то ещё. Но этоу же моделирование химических взаимодействий. реакций и пр.

Резюме:
На этот момент нужно достаточно чётко сформулировать ТЗ в версии для инвестора. Что программируется, с какой целью и что симулятор может показать в первой версии.

Значит программа должна писаться с учётом будущих трансформаций - изменений алгоритмов,
закономерностей каких-то и пр.

Т.е. Пикотехнология - продукт, который меняется постоянно.

Ну да, что-то типа компьютерной игры в белковые структуры сделать.

Хотя разговаривать - не камушки ворочать конечно.

Чем-то напоминает написание компьютерной игрушки. Как пишется компьютерная игра, понятно.

Va12220(Valqwa): непросто она пишется. но центр написания - один
напишем и эту "игрушку"
я на си не писал лет 10 к сожалению. сейчас и вспоминаю и разбираюсь и пишу одновременно

2017.04.27 14:20:42

Татьяна Рясина пишет:

поменять углы поворотов

Кушелев: Композиционные углы не менять надо, а настроить один раз. Дальше они уже будет слегка меняться с учётом физико-химических взаимодействий. И продавать нужно не программу, а конкретные структуры белков. Продажа прогрммы может привести к дискредитации научного направления, т.к. пользователи будут использовать её некорректно и получать неправильные результаты. Яркий пример - некто Leo, который взялся проводить экспертизу одной из первых версий программы Пикотех. Для начала он её изуродовал, т.е. упростил до такой степени, что она практически перестала работать. После этого раскритиковал. Чтобы этого безобразия не повторялось в будущем, нужно не программу продавать, а заказы на структуры белков выполнять. Онлайн-сервис - это тоже заказы. Но на уровне Пикотех-2D они могут выполняться автоматически. На уровне 3D пока лишь с ручной доработкой.

2017.04.27 14:25:51